对于气相色谱分析而言，良好的气源纯度对分析极为重要，除了保证气源的质量之外，气源的传输管线则显得极为重要。简单而言，传输管线应当光洁、干净和耐腐蚀。由此扩展，首先应当选择合适的管路材料，比如普通的铁管路应当避免采用，随着使用时间的增加，铁管路会被腐蚀和生锈，从而影响气体纯度，而铁锈则会损害阀、EPC等部件；其次，管路应当清洁，避免油污等；再次，避免使用聚四氟乙烯管路和其他聚合物管路，良好质量的聚四氟乙烯管路可以保证清洁，但是长期使用会伴随老化，导致氧气和水汽的渗透；如果选购的聚四氟乙烯管路质量稍差，管路可能会释放气体杂质导致气源受到污染。

为了保证输入气相色谱的气源和色谱内部气路的气体的清洁，建议从色谱耗材供应商处购买预处理过的、合乎清洁要求的管路，如果不能买到合乎要求的气体管路，应当自行对购买的管路进行清洗。清洗的一般步骤为：

1、如果管路上具有过多的油污，建议先用洗衣粉水超声和刷洗多次，之后用清水多次清洗干净，并用氮气或者无油污的压缩空气吹干，或者烘干；

2、对于油污较少的管路，可以使用丙酮进行浸泡和超声清洗以除去油污，并用氮气或者无油污的压缩空气吹干；

3、进行了以上操作之后，使用去离子水对管路进行浸泡和超声清洗以除去管路上可能存在的酸类和碱类物质；

4、最后使用乙醇等沸点较低的溶剂进行浸泡和超声清洗以除去可能残留的溶剂、水和其他物质；清洗之后，使用高纯氮气吹干或者在通氮气情况下对管路进行烘干；

5、清洗好的管路应当使用胶帽封口或者存放在不易被污染的地方等待使用。

     以上是清洗管路的基本过程，其根本目的在于除油、除酸碱。需要格外说明的是， 如果使用ECD检测器，应当避免使用二氯甲烷或其他卤化溶剂来清洁将与电子捕获检测器结合使用的管路。在将这些物质从系统中完全清除之前，这些物质会导致基线提升，并使检测器产生噪声。